Sovilnesib是的KIF18A抑制剂,能够阻止KIF18A在纺锤体微管(MT)上移动,导致染色体不稳定性 (CIN)肿瘤细胞有丝分裂延迟,出现多极纺锤体,以及细胞死亡,不影响正常细胞和接近正常的肿瘤细胞进行增殖。
结构:
介绍:
Sovilnesib(原研发编号AMG-650)是安进Amgen公司开发的KIF18A抑制剂。2023年3月7日Volastra Therapeutics宣布获得除中国外的全球独家授权,负责Sovilnesib的商业开发。
KIF18A是驱动蛋白家族亚家族Kinesin-8的成员。在部分癌症(例如乳腺癌和结直肠癌)中,KIF18A出现过表达,并且这与肿瘤的侵袭性有关。遗传不稳定是肿瘤细胞的共同特征,大量肿瘤细胞表现出频繁的染色体丢失或获得。这种染色体不稳定性 (CIN) 主要归因于染色体和有纺锤体之间的异常相互作用。抑制 KIF18A会导致CIN肿瘤细胞有丝分裂延迟,出现多极纺锤体,以及细胞死亡(Carolyn Marquis., 2021)。而不影响正常的体细胞和接近正常的肿瘤细胞进行增殖(Marc Payton., 2024)。小鼠实验,通过基因敲除 (KO) 使 Kif18a 功能失活,会导致雄性生殖细胞分裂缺陷,造成不育,在生殖组织之外,未发现会造成明显异常(Xue-Song Liu., 2010)。
在开发筛选KIF18A抑制剂的过程中,安进的研发人员从其化学分子库中,筛选到两个苗头化合物2和3(AM-7710)。2和3对于KIF18A的选择性,远高于另两种驱动蛋白Eg5和CENP-E。由于3的吡啶环结构衍化更加容易,研发人员选择3进一步进行优化(Nuria A Tamayo., 2022)。
由于3具有较快的肝线粒体清除率(MuLM|HLM CLint),优化的目标为保持选择性的同时,降低肝除率(CLint),并增加活性(IC50)。对3分子中哌啶4位的取代基(蓝色部门 R1),分子左侧的环戊基(紫色部分 R2)进行替换得到4-12。5和6为在R1位增加小的亲脂基团二甲基或环丙基,与3相比活性(IC50)显著增强,,但仍具有较快的肝除率。对于6在体内的代谢产物研究显示,主要在中心吡啶环(橙色)和左侧的环戊基发生氧化。
因些考虑对这两个部位进行修饰。使用亲脂性更低的异丙基替代6的环戊基,导致活性下降,但肝除率未出现显著变化。极性更强的8和9同样造成活性下降,但在人肝线粒体清除率方面,稍有改善。将环戊基砜结构,替换成磺酰氨结构(10),活性稍有下降。在10的酰氨结构的基础上,使用环丙基或叔丁基(11和12),活性强于10。12的活性强于6,配休效率(LE)相似,亲脂性效率(LipE)增加,亲脂性(cLogD)增加,但依旧具有较快的肝清除率。
在6和12的基础上将分子中心的吡啶环(橙色)用其它芳香环替换,以及在芳香环上增加取代基(绿色),得到13-24。13为6中心吡啶环的6位用甲氧基进行取代。尽管活性增强,但亲脂性增加,带来亲脂性效率降低,也未能改善肝清除率。将13的甲氧基换成乙醇氨基(14),分子活性显著增强,细胞生物效应(EC50)显著增强,亲脂性效率得到显著改善。对14乙醇氨基不同位置进行甲基化(15-17),未能改善肝清除率。但得到的分子活性和细胞生物效应强于14的17(AM-0277)。在17的基础上结合12的叔丁基磺酰氨结构,得到18。尽管18的分子活性稍稍降低,但大幅度改善了肝清除率。为了降低亲脂性,将18和乙醇氨基上的二甲基改为环丙基的类似物(19),维持活性的同时,肝清除率再次得到大幅改善。将18中心的吡啶改为吡嗪环(Y位和Z位)增加极性,同样得到肝清除率大幅改善的20。将18原苯环X位改为N(21),增分子活性,但未增加细胞生物活性,另外会导致肝清除率的大幅度增加。与18不同,将20苯环X位改为N(22),保持20原有肝清除率水平的同时,活性和细胞生物活性都得到增加。尽管22在体外实验中表现具有良好的生物活性,但体内实验显示,22的生物活性不足以维持到24小时。将20的吡嗪环改为苯环,在苯环上引入磺酰胺结构取代基增加极性,得到23和24。23和24与22相比生物活性增强,并且体内作用能够达到24小时。
将右侧磺酰氨基上取代基改为叔丁基得到早期构效候选药物AM-1882。改变右侧磺酰氨基的方向,将磺酰氨基上的叔丁基改为乙醇基,将原X位改为N,将左侧磺酰氨基改为吗啉环的衍生物,得到AM-5308。AM-5308与AM-1882相比在细胞内的活性进一步增加。由于AM-5308口服生物利用度差。将AM-5308左侧吡啶环改成嘧啶环的衍生物,将左侧吗啉环的衍生物改为4,4-二氟哌啶得到Sovilnesib(AMG-650)。在Sovilnesib右侧的乙醇基上增加一个甲基得到AM-9022。Sovilnesib和AM-9022与AM-5308相比口服生物利用度得到显著改善。
使用Sovilnesib的结构类似物作为探针,冷冻电镜研究显示该类药物作用于KIF18A马达域的α4和α6螺旋之间的变构口袋,阻止KIF18A在微管(MT)上移动。与传统的微管靶向剂(MTA)紫杉醇等药物相比,Sovilnesib不直接作用于微管,引起骨髓抑制和神经毒性的风险低(Nuria A Tamayo., 2022)。
2024年4月16日,Volastra Therapeutics宣布Sovilnesib的1b期临床试验已完成首例患者首次给药。本次Sovilnesib的1b临床试验用于初步评估Sovilnesib对于铂类耐药或难治性高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)患者中的疗效,为2期临床试验提供依据(Volastra., 2024)。
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KIF18A抑制剂369
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